1. Способ модулирования функции и/или экспрессии полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом, составляющим в длину от 5 до 30 нуклеотидов, причем указанный по меньшей мере один олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную последовательности, обратно комплементарной полинуклеотиду, содержащему от 5 до 30 последовательных нуклеотидов в рамках от 1 до 1235 нуклеотида последовательности SEQ ID SEQ ID NO: 6, от 1 до 17964 нуклеотида последовательности SEQ ID NO: 7, от 1 до 1 до 50003 нуклеотида последовательности SEQ ID SEQ ID NO: 8, от 1 до 486 нуклеотида последовательности SEQ ID NO: 9, от 1 до 494 нуклеотида последовательности SEQ ID NO: 10, от 1 до 1992 нуклеотида последовательности SEQ ID NO: 11, или от 1 до 1767 нуклеотида последовательности SEQ ID NO: 12; с модулированием, таким образом, функции и/или экспрессии указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro.
2. Способ модулирования функции и/или экспрессии полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом, составляющим в длину 5-30 нуклеотидов, причем указанный по меньшей мере один олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную обратно комплементарной последовательности природной антисмысловой последовательности к полинуклеотиду гена развития поджелудочной железы; с модулированием, таким образом, функции и/или экспрессии указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro. 3. Способ модулирования функции и/или экспрессии полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом, составляющим в длину 5-30 нуклеотидов, причем указанный олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную антисмысловому олигонуклеотиду к указанному полинуклеотиду гена развития поджелудочной железы; с модулированием, таким образом, функции и/или экспрессии указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro. 4. Способ модулирования функции и/или экспрессии полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом, который нацелен на участок природного антисмыслового олигонуклеотида указанного полинуклеотида-гена развития поджелудочной железы; с модулированием, таким образом, функции и/или экспрессии указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях пациента in vivo или in vitro. 5. Способ по п.4, отличающийся тем, что функцию и/или экспрессию указанного гена развития поджелудочной железы повышают in vivo или in vitro относительно контроля. 6. Способ по п.4, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один антисмысловой олигонуклеотид нацелен на природную антисмысловую последовательность полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 7. Способ по п.4, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один антисмысловой олигонуклеотид нацелен на последовательность нуклеиновой кислоты, содержащую кодирующие и/или не-кодирующие последовательности нуклеиновых кислот полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 8. Способ по п.4, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один антисмысловой олигонуклеотид нацелен на перекрывающиеся и/или неперекрывающиеся последовательности полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 9. Способ по п.4, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один антисмысловой олигонуклеотид содержит одну или более модификаций, выбранных из следующих: по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара, по меньшей мере одна модифицированная межнуклеозидная связь, по меньшей мере один модифицированный нуклеотид и их комбинации. 10. Способ по п.9, отличающийся тем, что указанные одна или более модификаций включают по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара, выбранный из следующих: фрагмент 2'-O-метоксиэтил модифицированного сахара, фрагмент 2'-метокси модифицированного сахара, фрагмент 2'-O-алкил модифицированного сахара, фрагмент бициклического сахара и их комбинации. 11. Способ по п.9, отличающийся тем, что указанные одна или более модификаций включают по меньшей мере одну модифицированную межнуклеозидную связь, выбранную из: фосфотиоата, 2'-O-метоксиэтила (МОЭ), 2'-фтора, алкилфосфоната, фосфородитиоата, алкилфосфонотиоата, фосфорамидата, карбамата, карбоната, фосфата триэфира, ацетамидата, карбоксиметилового эфира и их комбинаций. 12. Способ по п.9, отличающийся тем, что указанные одна или несколько модификаций включают по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, выбранный из: пептидной нуклеиновой кислоты (ПНК), закрытой нуклеиновой кислоты (ЗНК), арабино-нуклеиновой кислоты (ФАНК), аналога, производного и их комбинаций. 13. Способ по п.1, отличающийся тем, что указанный по меньшей мере один олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну олигонуклеотидную последовательность, представленную в последовательностях SEQ ID NO: 13-45. 14. Способ модулирования функции и/или экспрессии гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях млекопитающих in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним олигонуклеотидом малой интерферирующей РНК (миРНК), составляющим в длину 5-30 нуклеотидов, причем указанный по меньшей мере один миРНК олигонуклеотид специфичен для антисмыслового полинуклеотида полинуклеотида гена развития поджелудочной железы, причем указанный по меньшей мере один олигонуклеотид миРНК имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную комплементарной последовательности, состоящей из по меньшей мере приблизительно пяти последовательных нуклеиновых кислот антисмысловой и/или смысловой молекулы нуклеиновой кислоты указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы; и модулирование функции и/или экспрессии гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях млекопитающих in vivo или in vitro. 15. Способ по п.14, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 80% идентичную последовательности, состоящей из по меньшей мере приблизительно пяти последовательных нуклеиновых кислот, комплементарной антисмысловой и/или смысловой молекуле нуклеиновой кислоты указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 16. Способ модулирования функции и/или экспрессии гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях млекопитающих in vivo или in vitro, включающий: приведение указанных клеток или тканей в контакт по меньшей мере с одним антисмысловым олигонуклеотидом, составляющим в длину приблизительно 5-30 нуклеотидов, специфичных для некодирующих и/или кодирующих последовательностей смысловой и/или природной антисмысловой цепи полинуклеотида гена развития поджелудочной железы, причем указанный по меньшей мере один антисмысловой олигонуклеотид имеет последовательность, по меньшей мере на 50% идентичную по меньшей мере одной последовательности нуклеиновой кислоты из представленных в последовательностях SEQ ID NOS: 1-12; и модулирование функции и/или экспрессии указанного гена развития поджелудочной железы в клетках или тканях млекопитающих in vivo или in vitro. 17. Синтетический модифицированный олигонуклеотид, содержащий по меньшей мере одну модификацию, причем указанная по меньшей мере одна модификация выбрана из: по меньшей мере одного модифицированного фрагмента сахара; по меньшей мере одной модифицированной межнуклеотидной связи; по меньшей мере одного модифицированного нуклеотида; и их комбинаций; причем указанный олигонуклеотид представляет собой антисмысловое соединение, которое гибридизуется с геном развития поджелудочной железы и модулирует его функцию и/или экспрессию in vivo или in vitro по сравнению с контролем. 18. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанная по меньшей мере одна модификация содержит межнуклеотидную связь, выбранную из группы, состоящей из: фосфотиоата, алкилфосфоната, фосфородитиоата, алкилфосфонотиоата, фосфорамидата, карбамата, карбоната, фосфата триэфира, ацетамидата, карбоксиметилового эфира и их комбинаций. 19. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит по меньшей мере одну фосфотиоатную межнуклеотидную связь. 20. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит остов из фосфотиоатных межнуклеотидных связей. 21. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный нуклеотид, причем указанный модифицированный нуклеотид выбран из: пептидной нуклеиновой кислоты, закрытой нуклеиновой кислоты (ЗНК), их аналога, производного и комбинации. 22. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит множество модификаций, причем указанные модификации включают модифицированные нуклеотиды, выбранные из: фосфотиоата, алкилфосфоната, фосфородитиоата, алкилфосфонотиоата, фосфорамидата, карбамата, карбоната, фосфата триэфира, ацетамидата, карбоксиметилового эфира и их комбинации. 23. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит множество модификаций, причем указанные модификации включают модифицированные нуклеотиды, выбранные из: пептидных нуклеиновых кислот, закрытых нуклеиновых кислот (ЗНК), их аналогов, производных и комбинаций. 24. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит по меньшей мере один модифицированный фрагмент сахара, выбранный из: фрагмента 2'-метоксиэтил-модифицированного сахара, фрагмента 2'-метокси-модифицированного сахара, фрагмента 2'-O-алкил-модифицированного сахара, фрагмента бициклического сахара и их комбинации. 25. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит множество модификаций, причем указанные модификации включают модифицированные фрагменты сахара, выбранные из: фрагмента 2'-метоксиэтил модифицированного сахара, фрагмента 2'-метокси модифицированного сахара, фрагмента 2'-O-алкил модифицированного сахара, фрагмента бициклического сахара и их комбинации. 26. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что длина указанного олигонуклеотида составляет по меньшей мере приблизительно 5-30 нуклеотидов и указанный олигонуклеотид гибридизуется с антисмысловой и/или смысловой цепью полинуклеотида гена развития поджелудочной железы, причем указанный олигонуклеотид имеет последовательность по меньшей мере приблизительно на 20% идентичную комплементарной последовательности, состоящей из по меньшей мере приблизительно пяти последовательных нуклеиновых кислот антисмысловых и/или смысловых кодирующих и/или некодирующих последовательностей нуклеиновых кислот указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 27. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид имеет последовательность по меньшей мере приблизительно на 80% идентичную комплементарной последовательности из по меньшей мере приблизительно пяти последовательных нуклеиновых кислот антисмысловой и/или смысловой кодирующей и/или некодирующей последовательности нуклеиновой кислоты указанного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы. 28. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид гибридизуется по меньшей мере с одним полинуклеотидом гена развития поджелудочной железы и модулирует его экспрессию и/или функцию in vivo или in vitro по сравнению с контролем. 29. Олигонуклеотид по п.17, отличающийся тем, что указанный олигонуклеотид содержит последовательности, представленные в последовательностях SEQ ID NO: 13-45. 30. Композиция, содержащая один или более олигонуклеотид, специфичный для одного или более полинуклеотида гена развития поджелудочной железы, причем указанные полинуклеотиды включают антисмысловые последовательности, комплементарные последовательности, аллели, гомологи, изоформы, варианты, производные, мутанты, фрагменты или их комбинации. 31. Композиция по п.30, отличающаяся тем, что указанные олигонуклеотиды имеют последовательности, по меньшей мере приблизительно на 40% идентичные любым нуклеотидным последовательностям, представленным в последовательностях SEQ ID NO: 13-45. 32. Композиция по п.30, отличающаяся тем, что указанные олигонуклеотиды содержат нуклеотидные последовательности, представленные в последовательностях SEQ ID NO: 13-45. 33. Композиция по п.32, отличающаяся тем, что олигонуклеотиды, представленные в последовательностях SEQ ID NO: 13-45, содержат одну или более модификацию или замену. 34. Композиция по п.33, отличающаяся тем, что указанная одна или более модификация выбрана из: фосфотиоата, метилфосфоната, пептидной нуклеиновой кислоты, молекулы закрытой нуклеиновой кислоты (ЗНК) и их комбинации. 35. Способ предотвращения или лечения заболевания, связанного по меньшей мере с одним полинуклеотидом гена развития поджелудочной железы и/или по меньшей мере одним кодируемым указанным полинуклеотидом продуктом, включающий: введение пациенту терапевтически эффективной дозы по меньшей мере одного антисмыслового олигонуклеотида, который связывается с природной антисмысловой последовательностью указанного по меньшей мере одного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы и модулирует экспрессию указанного по меньшей мере одного полинуклеотида гена развития поджелудочной железы; обеспечивая, таким образом, предупреждение или лечение заболевания, связанного с указанным по меньшей мере одним полинуклеотидом гена развития поджелудочной железы и/или с по меньшей мере одним кодируемым указанным полинуклеотидом продуктом. 36. Способ по п.35, отличающийся тем. что заболевание, связанное с указанным по меньшей мере одним полинуклеотидом гена развития поджелудочной железы выбрано из заболевания или расстройства, связанного с анормальной функцией и/или экспрессией гена развития поджелудочной железы, заболевания или расстройства, связанного с анормальной функцией и/или экспрессией любых из перечисленных в таблице 1 генов, сердечно-сосудистого заболевания или расстройства (например, застойной сердечной недостаточности, инфаркта миокарда, ишемической болезни, атриальной или желудочковой аритмии, гипертензии сосудистого происхождения, болезни периферических сосудов, атеросклероза и т.д.), воспаления, желудочно-кишечного заболевания или расстройства (например, заболевания пищевода, ахалазии, гипертонической ахалазии, дисфагии, нарушения перстневидноглоточной координации, предпищеводной дисфагии, диффузного спазма пищевода, синдрома «комка в горле», метаплазии Барретта, гастроэзофагеального рефлюкса и т.д.), заболевания или расстройства желудка и/или двенадцатиперстной кишки (например, функциональной диспепсии, воспаления слизистой оболочки желудка, гастрита, стрессового гастрита, хронического эрозивного гастрита, атрофии желудочных желез, метаплазии желудочных тканей, язв желудка, язв двенадцатиперстной кишки, новообразований желудка), заболевания или расстройства поджелудочной железы (например, острого или хронического панкреатита, недостаточности экзокринных или эндокринных тканей поджелудочной железы, например, стеатореи, диабета и т.д.), новообразования экзокринной или эндокринной части поджелудочной железы (например, синдрома множественных эндокринных неоплазий, протоковой аденокарциномы, цистаденокарциномы, опухоли островков поджелудочной железы, инсулиномы, гастриномы, карциноидных опухолей, глюкагономы, синдрома Золлингера-Эллисона, ВИПомы, синдрома мальабсорбции и т.д.), заболевания или расстройства кишечника (например, хронического воспалительного заболевания кишечника, болезни Крона, кишечной непроходимости, диареи и запора, атонии толстой кишки, мегаколона, синдрома мальабсорбции, язвенного колита, функционального расстройства кишечника, синдрома раздраженного кишечника и т.д.,), новообразования кишечника (например, семейного полипоза, аденокарциномы, первичной злокачественной лимфомы, карциноидных опухолей, саркомы Калоши, полипов, рака толстой и прямой кишки); заболевания или расстройства печени (такого как нарушение обмена билирубина, желтуха, синдромы Жильбера, Криглера-Найяра, Дубина-Джонсона и Ротора; внутрипеченочный холестаз, гепатомегалия, портальная гипертензия, асцит, синдром Бадда-Киари, портальная системная энцефалопатия, жировая дистрофия печени, стеатоз, синдром Рейе, заболевание печени в результате употребления алкоголя, алкогольный гепатит или цирроз, фиброз, цирроз и т.д.), фиброза и/или цирроза печени из-за врожденных нарушений обмена веществ или экзогенных веществ, болезни или расстройства накопления, синдромов Гоше и Цельвегера, болезни Вильсона, острого или хронического гепатита, вирусного гепатита, и их вариантов; воспаления печени в результате поражения вирусом, бактериями, грибами, простейшими, гельминтами; медикаментозного заболевания или расстройства печени, хронического заболевания печени, такого как первичный склерозируюший холангит, дефицита альфа-1-антитрипсина, первичного биллиарного цирроза, послеоперационного заболевания печени, такого как послеоперационный внутрипеченочный холестаз, печеночной гранулемы, сосудистого заболевания или расстройства печени, связанного с системным заболеванием, доброкачественных или злокачественных опухолей печени, нарушений обмена веществ в печени новорожденных или недоношенных детей, заболевания опорно-двигательного аппарата (такого как остеопороз, постменопаузальный остеопороз, старческий остеопороз, вторичный остеопороз, идиопагический ювенильный остеопороз, костная болезнь Педжета, остеохондрома, костно-хрящевой экзостоз и т.д.), опухоли кости (например, доброкачественных хондром, хондробластом, хондромиксоидных фибром, остеоидных остеом, гигантоклеточной опухоли кости, множественной миеломы, остеосаркомы (остеогенная саркома), фибросаркомы, злокачественной фиброзной гистиоцитомы, хондросаркомы, опухоли Юинга (саркома Юинга), злокачественной лимфомы кости (ретикулярно-клеточная саркома, метастатические опухоли кости), остеоартрита, подагры и псевдоподагры; расстройства суставов и соединительной ткани (например, ревматоидный артрит, псориатический артрит, дискоидная красная волчанка, системная красная волчанка, склеродермия (системный склероз), синдрома Шегрена, болезни соединительной ткани, полимиозита и дерматомиозита, рецидивирующего полихондрита, васкулита, узелкового полиартериита, ревматической полимиалгии, височного артериита, гранулематоза Вегенера, синдрома Рейтера, синдрома Бехчета, анкилозирующего спондилита или суставов Шарко (нейрогенная артропатия) и т.д.); инфекций костей и суставов (например, остеомиелит и инфекционный артрит); заболевания или расстройства мышц, сумок и/или сухожилий (например, спастическая кривошея, синдромы фибромиалгии (миофасциальные болевые синдромы, фибромиозит), бурсит, тендинит и тендосиновит), проблем со ступнями (например, растяжение связок голеностопного сустава, переломы ступни, пяточные шпоры, синдром Севера, задний бурсит ахиллова сухожилия, передний бурсит ахиллова сухожилия, невралгия заднего большеберцового нерва, боли в голеностопном суставе (вызванные повреждением нервов между пальцами или суставов между пальцами и ступней), онихомикоз, или обесцвечивание ногтей), рака, воспалительного заболевания или расстройства, такого как: реакции гиперчувствительности типов I-IV (например, гиперчувствительность легких, включая астму, атопические заболевания, аллергический ринит или конъюктивит, ангионевротический отек век, наследственный ангионевротический отек, антирецепторные реакции гиперчувствительности и аутоиммунные заболевания, тиреоидит Хашимото, системная красная волчанка, синдром Гудпасчера, пузырчатка, тяжелая миастения, базедова болезнь и болезнь Рейно, инсулинорезистентный диабет В-типа, ревматоидный артрит, псориаз, болезнь Крона, склеродермия, смешанное заболевание соединительной ткани, полимиозит, саркоидоз, гломерулонефрит, острые или хронические реакции «хозяин против трансплантата»); легочное заболевание или расстройство, такое как: хроническая обструктивная болезнь легких (ХОБЛ); расстройства мочевыделительной системы, такого как: злокачественные заболевания органов мочеполовой системы женщин и мужчин, заболевания или расстройства почек, такого как острая или хроническая почечная недостаточность, иммунологически опосредованные заболевания почек, такие как отторжение почечного трансплантата, волчаночный нефрит, иммунокомплексные заболевания почек, гломерулопатии, нефрит, токсическая нефропатия, обструктивная уропатия, например, доброкачественная гиперплазия предстательной железы (ДГПЖ), синдром нейрогенного мочевого пузыря, недержание мочи, такое как неотложное недержание мочи, стрессовое недержание мочи или недержание мочи вследствие переполнения мочевого пузыря, тазовая боль и эректильная дисфункция, заболевания или расстройства, связанного с нарушениями развития эндокринной части поджелудочной железы (например, сахарный диабет 2 типа); заболевания или расстройства, связанного с дефектами нейрогенеза; нейродегенерагивного заболевания или расстройства (например, болезнь Альцгеймера, болезнь Паркинсона, амиотрофический латеральный склероз и т.д.); заболевания или расстройства, связанного с нарушениями развития вестибулярного и/или слухового аппарата, заболевания или расстройства, связанного с дегенерацией фоторецепторных клеток (например, потеря зрения, возрастная макулярная дегенерация и т.д.), ожирения, заболевания или расстройства, связанного с нарушениями функционирования печени (например, печеночная недостаточность), порошкообразной катаракты, голубой катарактаы несиндромной врожденной катаракты, врожденного синдрома катаракты-микрокорнеа, заболевания или расстройства поджелудочной железы (например, диабет, MODY-диабет, частичный агенез поджелудочной железы, хроническая гипершикемия, недостаточность бета-клеток поджелудочной железы, глюкозотоксичность, нарушение толерантности к глюкозе, метаболический синдром Х и т.д.), болезни Крона, инфаркта миокарда, гиперхолестеринемии, внутричерепного атеросклероза, церебрального инфаркта, герпесвирусной инфекции, заболевания или расстройства, связанного с нарушением липидного обмена, заболевания или расстройства, связанного с синтезом инсулина, заболевание заболевания или расстройства, связанного с синтезом серотонина (например, ожирение и депрессия), неврологического заболевания или расстройства (в том числе расстройств, связанных с невральными дефектами (например, дефектами моторных нейронов, серотонин-продуцирующих нейронов, допаминовых нейронов, и дефекты развития переднего мозга, среднего мозга, заднего мозга и спинного мозга) и т.д.), заболевания репродуктивной системы и заболевания или расстройства обмена веществ, такого как диабет (например, диабет 2 типа; инсулин-независимый сахарный диабет). 37. Способ идентификации и выбора по меньшей мере одного олигонуклеотида для введения in vivo, включающий: выбор целевого полинуклеотида, связанного с болезненным состоянием; идентификацию по меньшей мере одного олигонуклеотида, содержащего по меньшей мере пять последовательных нуклеотидов, комплементарных выбранному целевому полинуклеотиду или антисмысловому полинуклеотиду выбранного целевого полинуклеотида; определение температуры плавления гибрида антисмыслового олигонуклеотида и целевого полинуклеотида или антисмыслового полинуклеотида к выбранному целевому полинуклеотиду при гибридизации в жестких условиях; и выбор по меньшей мере одного олигонуклеотида для введения in vivo на основании полученной информации.
Читать аннотацию полностью
Скрыть аннотацию